IMAGEREVEAL™ MS - サポート

MSイメージングデータ解析ソフトウェア

操作方法・トラブルシューティング

1. はじめに

サンプルデータのダウンロード

マウス肝臓のデータ（基本解析用）　Mouse_Liver_a.zip
マウス肝臓のデータ（定量用）　Mouse_Liver_Quant.zip
マウス精巣のデータ（差異解析、画像解析用）　Mouse_Testicle_a.zip
酵母のデータ（スクリーニング用）　Yeast_Screening.zip

データフォーマットとデータ変換可能なフォーマットについて

IMAGEREVEAL MSは，IMDX形式のファイルを読み込むことができます。
以下の4つの形式のファイルは、本ソフトウェアに付属のデータコンバーター「IMDX Converter」を用いて、IMDXファイルに変換できます。

データ変換手順の説明資料（英）　PDF

1. kbd

iMScopeシリーズで取得したデータ形式です。

iMScopeシリーズで取得したkbdファイルは、LCMSsolution（Ver. 3.81以降）がインストールされていないと変換できません。

2. Analyze 7.5

AXIMAシリーズでエクスポートしたデータ形式です。

AXIMAシリーズ以外でエクスポートした「Analyze 7.5 形式」のデータはサポートしていません。
IMDXファイルに変換可能なAnalyze 7.5ファイルは、総スポット数が38000点以下、m/zの範囲は5～500000のファイルです。

3. imzML

MSイメージング用の共通データフォーマットです。

Processed形式のimzMLファイルをIMDXファイルに変換すると、設定されたサンプリング間隔（元データがセントロイドの場合はピーク幅）で補間が行われ、すべての測定点で同じサンプリング位置のプロファイルデータが保存されます。そのため、元データのサンプリング位置とは厳密には一致しません。
MALDI-7090以外の「imzML」形式のデータは、IMDXファイルへの変換ができない場合があります。MALDI-7090以外の「imzML」形式のデータでも動作実績はありますが、すべての「imzML」形式のデータファイルの変換を保証するものではありません。「imzML」形式を使用する場合、まずはデモ版で動作確認をしてください。　→データ変換実績（英）　PDF　
本製品では「imzML」形式のデータのうち「Continuous」、「Processed」タイプのプロファイルデータ、「Processed」タイプのセントロイドデータの動作実績があります。ただし、セントロイドデータはIMDX形式に変換する際にプロファイルデータに変換されます。　→Centroid とProfileの説明（英）　PDF　
IMDXファイルに変換可能なimzMLファイルは、XY方向のスポット数がそれぞれ65,535点以下、m/zの範囲は5～500,000のファイルです。

4. raw

Thermo Fisher Scientific社のデータファイル形式

技術的な問合せ

IMAGEREVEAL MSに関する技術的なお問合せは，専用のお問合せフォームへお願いします。

IMAGEREVEAL MS専用お問合せフォーム

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