LC/MS/MSメソッドパッケージ 細胞培養プロファイリング Ver.2
125 成分の高速一斉分析条件をご提供します
培地成分および細胞からの分泌代謝物から成る合計125成分を20分以内に一斉分析可能なメソッドです。従来はアミノ酸類、ビタミン類など化合物群ごとに分析が実施されてきたため手間がかかりましたが、本メソッドパッケージにより培地成分および分泌代謝物を20分以内に一斉分析できます。また、旧バージョンから、アミノ酸代謝、核酸代謝、TCAサイクルに関わる代謝物などを測定対象に追加することで、より詳細な細胞培養プロファイルの情報取得が可能となりました。
培地分析用にメソッドが最適化されています
ビタミンなどの微量成分は、トリプル四重極型質量分析計の性能を最大限に活かしつつ、グルコース、アミノ酸など高濃度で含まれる成分はシグナルが飽和しないような分析条件が設定されているため、同じバイアルから幅広い培地成分を測定することが可能です。
＊正確な定量結果を得るためには希釈系列を作製する必要があります。
"Ready to Use Method" をご提供します
LC/MS/MS 分析において必要となる分離条件の検討や各化合物に対するMS パラメータの最適化など、煩雑な作業をすることなく分析をはじめることができます。
データ解析機能を強化しました
マルチオミックス解析パッケージを用いることで、化合物量の変化のバーグラフによる比較、時系列変化の折れ線グラフによる表示などを簡単な操作で実施していただけます。
また、相関解析、Volcano Plotといった解析を簡便に実施できるため、ボトルネックとなるデータ解析・可視化の作業を大幅に削減し、測定からデータ解析までの操作をスムーズに実施していただけます。
データ解析事例
メソッドパッケージを用いた測定データを専用の白地図に投影することで、化合物量を比較したバーグラフの表示、時系列変化の折れ線グラフの表示が可能です。
データ解析用ツール
本メソッドパッケージでは、特定非営利活動法人システム・バイオロジー研究機構（SBI）が中心となり運営する研究用オープンプラットフォーム｢GARUDA™｣上に公開されているツール（ガジェット）をベースに開発されたデータ解析用ツールを提供しています。
メソッドパッケージで利用可能なデータ解析用ツール
Volcano Plot
t検定（統計的有意差）とfold解析（例：2倍、1/2など平均値の差）を組み合わせた手法で、2群間の差の可視化が可能なツールです。島津製作所が開発のVolcano Plotガジェットがパッケージに組み込まれています。
VANTED
豪州 Monash UniversityによりGARUDAサポートされ、独University of Konstanzが維持するデータ間のネットワークの可視化と解析のためのツールです。代謝物プロファイリングや酵素活性データを代謝マップ上で可視化し、生物学的プロセスの解析をサポートします。
Cytoscape
Cytoscape Consortiumにより開発された代謝パスウェイの可視化や遺伝子発現プロファイルと関連データの統合などに用いられるバイオインフォマティクス用のツールです。ネットワーク分析、相関の可視化に威力を発揮します。
登録化合物一覧
| Amino acids and their metabolites | Group |
|---|---|
|
5-Oxoproline
Alanine Asparagine Aspartic acid Glutamic acid Glutamine N-Acetylaspartic acid 4-Aminobutyric acid 4-Hydroxyproline Arginine Citrulline Ornithine Proline Putrescine Argininosuccinic acid 2-Aminobutyric acid 5-Glutamylcysteine 5'-Methylthioadenosine Cystathionine Cysteine Cystine Glutathione Homocysteine Methionine Methionine sulfoxide N-Acetylcysteine Oxidized glutathione S-Adenosylhomocysteine Glycine Serine Threonine 1-Methylhistidine 3-Methylhistidine Histidine Urocanic acid 2-Aminoadipic acid Hydroxylysine Lysine Pipecolic acid Saccharopine 3-Hydroxyanthranilic acid 5-Hydroxytryptophan Anthranilic acid Formylkynurenine Hydroxykynurenine Indole-3-acetic acid Kynurenic acid Kynurenine
Serotonin Tryptophan 4-Hydroxyphenyllactic acid Phenylalanine Tyrosine 3-Hydroxyisobutyric acid 3-Methyl-2-oxovaleric acid Isoleucine Leucine Valine Alanyl-glutamine Glycyl-glutamine |
Ala, Asp and Glu MT
Ala, Asp and Glu MT Ala, Asp and Glu MT Ala, Asp and Glu MT Ala, Asp and Glu MT Ala, Asp and Glu MT Ala, Asp and Glu MT Arg MT Arg MT Arg MT Arg MT Arg MT Arg MT Arg MT Arg MT Cys and Met MT Cys and Met MT Cys and Met MT Cys and Met MT Cys and Met MT Cys and Met MT Cys and Met MT Cys and Met MT Cys and Met MT Cys and Met MT Cys and Met MT Cys and Met MT Cys and Met MT Gly and Ser MT Gly and Ser MT Gly and Ser MT His MT His MT His MT His MT Lys MT Lys MT Lys MT Lys MT Lys MT Trp MT Trp MT Trp MT Trp MT Trp MT Trp MT Trp MT Trp MT
Trp MT Trp MT Tyr MT Tyr MT Tyr MT Val MT Val MT Val MT Val MT Val MT — — |
| Others | Group |
|---|---|
| 2-ketoglutaric acid Acotinic acid Citric acid Fumaric acid Isocitric acid Lactic acid Malic acid Pyruvic acid Succinic acid Penicillin G 2-Aminoethanol Glyceric acid NAD O-Phosphoethanolamine Taurine |
TCA Cycle TCA Cycle TCA Cycle TCA Cycle TCA Cycle TCA Cycle TCA Cycle TCA Cycle TCA Cycle Antibiotics — — — — — |
| Nucleic acids and their metabolites | Group |
|---|---|
| Adenine Adenosine Adenosine monophosphate Deoxyadenosine Deoxyadenosine monophosphate Deoxyguanosine Deoxyguanosine monophosphate Guanine Guanosine Guanosine monophosphate Hypoxanthine Inosine Inosine monophosphate Uric acid Xanthine Xanthosine Xanthosine monophosphate 3-Aminoisobutyric acid 3-Aminopropanoic acid Cytidine Cytidine monophosphate Cytosine Deoxycytidine Deoxycytidine monophosphate Orotic acid Thymidine Thymidine monophosphate Thymine Uracil Uridine Uridine monophosphate |
Purine MT Purine MT Purine MT Purine MT Purine MT Purine MT Purine MT Purine MT Purine MT Purine MT Purine MT Purine MT Purine MT Purine MT Purine MT Purine MT Purine MT Pyrimidine MT Pyrimidine MT Pyrimidine MT Pyrimidine MT Pyrimidine MT Pyrimidine MT Pyrimidine MT Pyrimidine MT Pyrimidine MT Pyrimidine MT Pyrimidine MT Pyrimidine MT Pyrimidine MT Pyrimidine MT |
| Sugars | Group |
|---|---|
| Gluconic acid Hexose (Glucose) Sucrose Threonic acid |
— — — — |
| Vitamins | Group |
|---|---|
| Riboflavin Niacinamide Nicotinic acid Pantothenic acid 4-Pyridoxic acid Pyridoxal Pyridoxalphosphate Pyridoxine Biotin 4-Aminobenzoic acid Folic acid Choline Ascorbic acid Cyanocobalamin Lipoic acid |
B2 B3 B3 B5 B6 B6 B6 B6 B7 B9 B9 B12 C Vitamin-like Vitamin-like |
| Internal standard | Group |
|---|---|
| 2-Isopropylmalic acid | — |
注意事項
- LabSolutions™ LCMS™ は、Ver. 5.97 以降が必要です。
- 本システムで得られる定性及び定量情報は、確認のために標準試料を用いた試験を実施してください。
I N F O R M A T I O N
⇒（関連製品1）超高速トリプル四重極型LC/MS/MSシステム LCMS-8060
⇒（関連製品2）LC/MSソリューションシステムパッケージ
⇒（関連製品3）ライフサイエンス関連機器/試薬/細胞解析製品
- 細胞培地分析プラットフォームC2MAP™用いたヒトiPS細胞の未分化性の評価
※細胞培養プロファイリングVer.1で取得した内容になります。
R E F E R E N C E
| カテゴリ | タイトル | 難易度 |
| HPLC 1. | HPLCで用いる基本用語のはなし | 易 |
| HPLC 2. | 続・HPLCで用いる基本用語のはなし | やや難 |
| HPLC 3. | 糖類の検出法～分離法 | やや難 |
| HPLC 4. | アミノ酸の分析法 | やや難 |
| HPLC 5. | 理論段数の計算式 | やや難 |
| HPLC 6. | 移動相の作り方 -溶媒混合比の話- | 易 |
| HPLC 7. | 試料調製時の定量誤差要因 | 易 |
| HPLC 8. | 試料溶媒がピーク形状に与える影響 | やや難 |
| HPLC 9. | TFA (トリフルオロ酢酸)入り 水/アセトニトリル グラジエントのベースライン | やや難 |
| HPLC 10. | in the LAB 超高速LCのためのデータ処理パラメータの基本設定 | 易 |
| LC/MS 1. | LC-MSのはなし その3「APIでのマススペクトル」 | 易 |
| LC/MS 2. | LC-MSの分析条件について その1「第一選択移動相の基礎」 | 易 |
| LC/MS 3. | 多変量解析（主成分分析）を活用したクロマトデータ解析 | やや難 |
LabSolutionsおよびLCMSは，株式会社島津製作所の商標です。
GARUDAは，システム・バイオロジー研究機構の商標です。
本文書に記載されている会社名，製品名、サービスマークおよびロゴは，各社の商標および登録商標です。
なお、本文中では「TM」，「®」を明記していない場合があります。
本製品は，医薬品医療機器法に基づく医療機器として承認・認証等を受けておりません。
治療診断目的およびその手続き上での使用はできません。
トラブル解消のため補修用部品・消耗品は純正部品をご採用ください。
外観および仕様は、改良のため予告なく変更することがありますのでご了承ください。