LC/MS/MSメソッドパッケージ 細胞培養プロファイリング Ver.2

125 成分の高速一斉分析条件をご提供します

培地成分および細胞からの分泌代謝物から成る合計125成分を20分以内に一斉分析可能なメソッドです。従来はアミノ酸類、ビタミン類など化合物群ごとに分析が実施されてきたため手間がかかりましたが、本メソッドパッケージにより培地成分および分泌代謝物を20分以内に一斉分析できます。また、旧バージョンから、アミノ酸代謝、核酸代謝、TCAサイクルに関わる代謝物などを測定対象に追加することで、より詳細な細胞培養プロファイルの情報取得が可能となりました。



 

培地分析用にメソッドが最適化されています

ビタミンなどの微量成分は、トリプル四重極型質量分析計の性能を最大限に活かしつつ、グルコース、アミノ酸など高濃度で含まれる成分はシグナルが飽和しないような分析条件が設定されているため、同じバイアルから幅広い培地成分を測定することが可能です。
*正確な定量結果を得るためには希釈系列を作製する必要があります。

 

 

"Ready to Use Method" をご提供します

LC/MS/MS 分析において必要となる分離条件の検討や各化合物に対するMS パラメータの最適化など、煩雑な作業をすることなく分析をはじめることができます。


データ解析機能を強化しました

マルチオミックス解析パッケージを用いることで、化合物量の変化のバーグラフによる比較、時系列変化の折れ線グラフによる表示などを簡単な操作で実施していただけます。
また、相関解析、Volcano Plotといった解析を簡便に実施できるため、ボトルネックとなるデータ解析・可視化の作業を大幅に削減し、測定からデータ解析までの操作をスムーズに実施していただけます。

 



 

データ解析事例

メソッドパッケージを用いた測定データを専用の白地図に投影することで、化合物量を比較したバーグラフの表示、時系列変化の折れ線グラフの表示が可能です。



 

データ解析用ツール

本メソッドパッケージでは、特定非営利活動法人システム・バイオロジー研究機構(SBI)が中心となり運営する研究用オープンプラットフォーム「GARUDA™」上に公開されているツール(ガジェット)をベースに開発されたデータ解析用ツールを提供しています。



 

メソッドパッケージで利用可能なデータ解析用ツール

Volcano Plot
t検定(統計的有意差)とfold解析(例:2倍、1/2など平均値の差)を組み合わせた手法で、2群間の差の可視化が可能なツールです。島津製作所が開発のVolcano Plotガジェットがパッケージに組み込まれています。

VANTED
豪州 Monash UniversityによりGARUDAサポートされ、独University of Konstanzが維持するデータ間のネットワークの可視化と解析のためのツールです。代謝物プロファイリングや酵素活性データを代謝マップ上で可視化し、生物学的プロセスの解析をサポートします。

Cytoscape
Cytoscape Consortiumにより開発された代謝パスウェイの可視化や遺伝子発現プロファイルと関連データの統合などに用いられるバイオインフォマティクス用のツールです。ネットワーク分析、相関の可視化に威力を発揮します。

 

登録化合物一覧

 
Amino acids and their metabolites Group
5-Oxoproline
Alanine
Asparagine
Aspartic acid
Glutamic acid
Glutamine
N-Acetylaspartic acid
4-Aminobutyric acid
4-Hydroxyproline
Arginine
Citrulline
Ornithine
Proline
Putrescine
Argininosuccinic acid
2-Aminobutyric acid
5-Glutamylcysteine
5'-Methylthioadenosine
Cystathionine
Cysteine
Cystine
Glutathione
Homocysteine
Methionine
Methionine sulfoxide
N-Acetylcysteine
Oxidized glutathione
S-Adenosylhomocysteine
Glycine
Serine
Threonine
1-Methylhistidine
3-Methylhistidine
Histidine
Urocanic acid
2-Aminoadipic acid
Hydroxylysine
Lysine
Pipecolic acid
Saccharopine
3-Hydroxyanthranilic acid
5-Hydroxytryptophan
Anthranilic acid
Formylkynurenine
Hydroxykynurenine
Indole-3-acetic acid
Kynurenic acid
Kynurenine
Serotonin
Tryptophan
4-Hydroxyphenyllactic acid
Phenylalanine
Tyrosine
3-Hydroxyisobutyric acid
3-Methyl-2-oxovaleric acid
Isoleucine
Leucine
Valine
Alanyl-glutamine
Glycyl-glutamine
Ala, Asp and Glu MT
Ala, Asp and Glu MT
Ala, Asp and Glu MT
Ala, Asp and Glu MT
Ala, Asp and Glu MT
Ala, Asp and Glu MT
Ala, Asp and Glu MT
Arg MT
Arg MT
Arg MT
Arg MT
Arg MT
Arg MT
Arg MT
Arg MT
Cys and Met MT
Cys and Met MT
Cys and Met MT
Cys and Met MT
Cys and Met MT
Cys and Met MT
Cys and Met MT
Cys and Met MT
Cys and Met MT
Cys and Met MT
Cys and Met MT
Cys and Met MT
Cys and Met MT
Gly and Ser MT
Gly and Ser MT
Gly and Ser MT
His MT
His MT
His MT
His MT
Lys MT
Lys MT
Lys MT
Lys MT
Lys MT
Trp MT
Trp MT
Trp MT
Trp MT
Trp MT
Trp MT
Trp MT
Trp MT
Trp MT
Trp MT
Tyr MT
Tyr MT
Tyr MT
Val MT
Val MT
Val MT
Val MT
Val MT

Others Group
2-ketoglutaric acid
Acotinic acid
Citric acid
Fumaric acid
Isocitric acid
Lactic acid
Malic acid
Pyruvic acid
Succinic acid
Penicillin G
2-Aminoethanol
Glyceric acid
NAD
O-Phosphoethanolamine
Taurine
TCA Cycle
TCA Cycle
TCA Cycle
TCA Cycle
TCA Cycle
TCA Cycle
TCA Cycle
TCA Cycle
TCA Cycle
Antibiotics




 
Nucleic acids and their metabolites Group
Adenine
Adenosine
Adenosine monophosphate
Deoxyadenosine
Deoxyadenosine monophosphate
Deoxyguanosine
Deoxyguanosine monophosphate
Guanine
Guanosine
Guanosine monophosphate
Hypoxanthine
Inosine
Inosine monophosphate
Uric acid
Xanthine
Xanthosine
Xanthosine monophosphate
3-Aminoisobutyric acid
3-Aminopropanoic acid
Cytidine
Cytidine monophosphate
Cytosine
Deoxycytidine
Deoxycytidine monophosphate
Orotic acid
Thymidine
Thymidine monophosphate
Thymine
Uracil
Uridine
Uridine monophosphate
Purine MT
Purine MT
Purine MT
Purine MT
Purine MT
Purine MT
Purine MT
Purine MT
Purine MT
Purine MT
Purine MT
Purine MT
Purine MT
Purine MT
Purine MT
Purine MT
Purine MT
Pyrimidine MT
Pyrimidine MT
Pyrimidine MT
Pyrimidine MT
Pyrimidine MT
Pyrimidine MT
Pyrimidine MT
Pyrimidine MT
Pyrimidine MT
Pyrimidine MT
Pyrimidine MT
Pyrimidine MT
Pyrimidine MT
Pyrimidine MT
Sugars Group
Gluconic acid                    
Hexose (Glucose)
Sucrose
Threonic acid



Vitamins Group
Riboflavin          
Niacinamide
Nicotinic acid
Pantothenic acid
4-Pyridoxic acid
Pyridoxal
Pyridoxalphosphate
Pyridoxine
Biotin
4-Aminobenzoic acid
Folic acid
Choline
Ascorbic acid
Cyanocobalamin
Lipoic acid
B2
B3
B3
B5
B6
B6
B6
B6
B7
B9
B9
B12
C
Vitamin-like
Vitamin-like
Internal standard Group
2-Isopropylmalic acid        
 

注意事項

  1. LabSolutions™ LCMS™ は、Ver. 5.97 以降が必要です。
  2. 本システムで得られる定性及び定量情報は、確認のために標準試料を用いた試験を実施してください。

I N F O R M A T I O N

⇒(関連製品1)超高速トリプル四重極型LC/MS/MSシステム LCMS-8060
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R E F E R E N C E

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LabSolutionsおよびLCMSは,株式会社島津製作所の商標です。
GARUDAは,システム・バイオロジー研究機構の商標です。

本文書に記載されている会社名,製品名、サービスマークおよびロゴは,各社の商標および登録商標です。
なお、本文中では「TM」,「®」を明記していない場合があります。
本製品は,医薬品医療機器法に基づく医療機器として承認・認証等を受けておりません。
治療診断目的およびその手続き上での使用はできません。
トラブル解消のため補修用部品・消耗品は純正部品をご採用ください。
外観および仕様は、改良のため予告なく変更することがありますのでご了承ください。

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