マルチオミクス解析パッケージ - アプリケーション
LC/MS,GC/MSデータ解析用ソフトウェア
解析事例
一次代謝物メソッドパッケージを用いた大腸菌・酵母*の抽出物・培養上清の網羅的解析
細胞培養プロファイリングメソッドパッケージを用いたiPS細胞培養培地上清中の代謝物の時系列変化
胆汁酸メソッドパッケージを用いたマウス糞便中代謝物とヒト血漿の解析
LC/MSとGC/MSを用いた遺伝子変異ショウショウバエのメタボロミクス差異解析
~LC-MSデータとGC-MSデータの代謝マップ上での統合~
データ解析用ツール
マルチオミクス解析パッケージは、特定非営利活動法人システム・バイオロジー研究機構(SBI)が中心となり運営する研究用オープンプラットフォーム「GARUDA」上に公開されているツール(ガジェット)をベースに開発しています。
対応するメソッドパッケージおよびデータベース
種類 |
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LC/MS/MS メソッドパッケージ 一次代謝物 |
LC/MS/MS メソッドパッケージ 細胞培養プロファイリング |
LC/MS/MS メソッドパッケージ 脂質メディエータ |
LC/MS/MS メソッドパッケージ 胆汁酸 |
Smart Metabolites Database |
代謝物精密質量データベース |
※マルチオミクス解析パッケージはメソッドパッケージの一次代謝、細胞培養プロファイリングおよびMetabolites Method Package Suiteに付属しています。
※代謝物精密質量データベースの短鎖脂肪酸に対応する可視化用の白地図は用意されていません。
GARUDAは、システム・バイオロジー研究機構の商標です。