1. プロテインシーケンサとは？

プロテインシーケンサは、1950年にPehr Victor Edmanにより開発されたエドマン分解の自動化を実現した装置です。その反応系は次のとおりです。

（1）カップリング反応

塩基性雰囲気下で単離精製された試料タンパク質（ペプチドを含む）のN末端アミノ基にPITC（Phenyl isothiocyanate）を結合させます。

（2）切断反応

酸性条件でPITCの結合したN末端アミノ酸を切断し、アニリノチアゾリノン（Anilinothiazolinone: ATZ）誘導体として有機層に抽出します。

（3）転換反応

有機溶媒を揮発させ、抽出されたATZ誘導体を酸性水溶液中でPTH（Phenylthiohydantoin）アミノ酸とよばれる安定な誘導体に導きます。

PPSQ-50シリーズは、エドマン分解によって、タンパク質のN末端からアミノ酸（PTH-アミノ酸）を1残基ずつ切り出し、HPLCで分析することで、アミノ酸配列を決定する装置です。

右図のように、エドマン分解からHPLCによるPTH-アミノ酸分析までの一連の過程を1サイクルといいます。この過程を繰り返し、得られたPTH-アミノ酸を順に並べることで、タンパク質・ペプチドのN末端からのアミノ酸配列を簡単にかつ確実に決定します。データベースに登録されていないタンパク質のアミノ酸配列も決定できます。基礎研究だけでなく、抗体医薬品や食品中のタンパク質・ペプチドの分析など、様々な場面で利用できます。