3.流路中での気泡発生によるトラブル

　移動相ビン内の溶液に溶解している空気が飽和溶解量以下であっても，ポンプを通過する際に気泡が発生することがあります。

(1)低圧混合グラジエント ･･････異なる溶媒を大気圧(もしくはやや減圧)下で混合するため，メカニズム2-3)により，図11中赤ワクの所で気泡が発生します。 いくらグラジエントミキサがポンプ下流(高圧側)に設置してあっても，図中赤ワクの所ですでに混合が始まるので，多かれ少なかれ気泡発生が起こります。一方，高圧混合グラジエントの場合は，混合が始まる所がポンプ下流(高圧側)であるので，この問題は起こりません。

(2)サクションフィルタの目詰まり ･･････サクションフィルタが目詰まりしていると，吸引時の抵抗が大きく，フィルタ内部が減圧になって気泡が発生しやすくなります。目詰まりは，フィルタの放置によりゴミが付着したり，前の移動相が緩衝液であることを知らずにメタノールを流すことなどにより起こります。なお，目詰まりが軽度であれば，移動相の充分な脱気により気泡発生を防止できますが，これは本来は，フィルタの洗浄や交換によって解決すべき問題です。

これらによって発生するトラブルは3-1)の場合と同じです。