定性関連操作，ライブラリ関連操作

ピークが検出されていることを確認します。
メニューバーの［定性処理］をクリックし，［定性処理テーブルの表示］をクリックするか，定性処理アシスタントバーの［定性処理テーブル］アイコンをクリックし，［定性処理テーブル］ウィンドウを開きます。

定性処理テーブル下方の［TIC］タブをクリックし，ピークが検出されているか確認します。
手動波形処理で検出されたピークには，「マーク」の項目に”MI”と記されます。その行を指定すると，クロマトグラムビューに縦ラインが入ります。

定性処理テーブルにて検出結果を確認

名称を入力したい化合物のピークが検出されていない場合，波形処理を実行しピーク検出を行います（事前にピーク検出されている場合は，この作業は不要です）。
クロマトグラムビューにTICもしくはMICが表示されている事を確認し，名称を入力したい化合物のピークがはっきり見える様，拡大表示します。
（MCを表示させる場合は，スペクトルビューにて表示させたい質量をダブルクリックするか，フラグメントテーブルで質量を設定します）
名称を表示させたいTICもしくはMIC，MCを選択し，ピークの開始時間から終了時間の範囲にカーソルを置き，マウスを左右同時にクリックします。

化合物名を表示させるクロマトグラムとピークの選択

［化合物名の編集］ウィンドウが開いたら，名称を入力し，［OK］ボタンをクリックします。
クロマトグラムビュー上（図のピークトップ近傍）に化合物名が表示されることを確認します。

化合物名の入力と表示の確認

［検索条件テーブル〕

中段のヒットリストには検索結果の化合物が表示され，いずれかの化合物の行をクリックすると選んだ化合物の情報が表示されます。

更に検索結果から絞込み検索を行う場合は，次行に追加条件を入力しインデックス検索をします。　［ヒット数］を確認し，ヒット数が少なければヒットリストの化合物をクリックし，化合物情報から目的の化合物を確認します。

検索結果を印刷する場合は，印刷したい化合物の行を選択し，色を反転させます。　［ファイル］メニューの［検索結果の印刷］の［印刷］を選択します。　選んだ化合物が印刷されます。

全TICの波形処理で検出されたピークは，定性処理テーブルに登録されます。　［定性処理］メニューの［定性処理テーブルの表示］を選択して，定性処理テーブルを開きます。定性処理テーブルの［TIC］タブをクリックし，定性処理テーブルの検出されたピークから検索する化合物を選択します（すべての行を選択する場合は，［編集］メニューの［すべてを選択］）。　 ［編集］メニューの［スペクトル処理テーブルへ登録］をクリックしてスペクトル処理テーブルに登録します。

［定性処理テーブル］の［TIC］タブ

［定性処理］メニューの［定性処理パラメータ］を選択し，［定性処理パラメータ］画面が開きます。　［保持指標パラメータ］タブをクリックし，［データファイルから読み込み］ボタンをクリックして，1.で測定した基準化合物の測定データファイルを選択してデータファイルを開きます。　［定性処理パラメータ］画面の［基準化合物情報］に基準化合物が登録されたことを確認します。

［定性処理パラメータ］画面の
［保持指標パラメータ］タブ

［シミラリティ検索パラメータ］タブをクリック，［保持指標許容範囲］チェックボックスをオンにし，保持指標の許容幅を入力します。
保持指標の許容幅は，検索対象のスペクトルの保持指標を中心にして「＋」「－」の項目で設定した相対値で指定します。　検索対象の保持指標が下図の場合，（RIT－10）以上，（RIT＋10）以下が許容幅になります（RITとは，ターゲット化合物の保持指標）。　設定後，［OK］ボタンをクリックします。 次に保持指標を用いたシミラリティ検索を行います。

［定性処理パラメータ］画面の
［シミラリティ検索パラメータ］タブ

対象のピークトップをダブルクリックし，スペクトルビューにマススペクトルを表示させます。　必要なら減算処理などを行ってください。
スペクトルビュー上の右クリックメニューの［シミラリティ検索］をクリックします。　スペクトルの類似度に加えて，許容幅に入る保持指標を持つ化合物がライブラリから抽出され，シミラリティ検索結果画面に表示されます。

［GCMS再解析］ウィンドウ　データ解析画面で，[ファイル]メニューの[データファイルを開く]でシミラリティ検索するデータを開きます。　[クロマトグラムビュー]のターゲットピークトップをダブルクリックし，スペクトルビューにマススペクトルを表示させます。　必要なら減算処理などを行い，スペクトルビュー上の右クリックメニュー［シミラリティ検索］をクリックします。　シミラリティ検索後，結果を確認します。

［データ解析］画面

［シミラリティ検索結果］画面の［レポート］メニューの［検索結果］をクリックします。　初期設定では，類似度が高いほうから5個の化合物を印刷します。

［シミラリティ検索結果］画面

［GCMS再解析］ウィンドウで，[ファイル]メニューの[データファイルを開く]でデータを開きます。
化合物テーブルのスタイルを変更します。　［化合物テーブル]ビューの［編集］ボタンをクリックし，化合物テーブルを編集モードにします。　化合物テーブルの右クリックメニュー［テーブルスタイル］を選択します。　[テーブルスタイル]画面の［カラム順序の設定］タブをクリックします。
[非表示にするアイテム]から［標準スペクトル］を選び，［追加］ボタンをクリックします。　設定後，［OK］ボタンをクリックします。　既に表示するアイテムに［標準スペクトル］がある場合は，そのまま［OK］ボタンをクリックします。

[化合物テーブル]ビューの［表示］ボタンをクリックし化合物テーブルを表示モードにします。　化合物テーブル内のコンパウンドファインダー処理したい化合物の標準スペクトルを確認します(標準スペクトルが登録されていなければ，“表示スペクトルを標準スペクトルとして登録する”，もしくは“ライブラリのスペクトルを標準スペクトルとして登録する”をご覧ください。)。
標準スペクトルを確認したい場合は，確認したい化合物の行にマウスを移動し，右クリックメニューの［標準スペクトルの確認］をクリックします。　標準スペクトルが表示されますので，確認します。

再度［化合物テーブル]ビューの［編集］ボタンをクリックし，化合物テーブルを編集モードにします。　コンパウンドファインダー処理したい化合物の[タイプ]を［ディスカバリ］に変更します。
ディスカバリに変更したら，［表示］ボタンをクリックして表示モードに戻します。　バッチ処理で用いるならメソッドファイルへ保存してください。

［定量処理］メニューの［全IDの波形処理］を選択します。　[定量処理パラメータ]画面が開くので，波形処理パラメータを確認し，［OK］をクリックします。
[タイプ]を[ディスカバリ]設定されている化合物に対してコンパウンドファインダーが実行されます。　それ以外のタイプが設定されている化合物には通常の定量処理が適用されます。

[定性処理テーブル]で結果を確認できます。　[化合物テーブル]の［結果］タブをクリックすると，標準スペクトルに一番類似度の高いピークの保持時間が表示されます。　[クロマトビュー]にはコンパウンドファインダーで検出されたピークに線が表記されます。
また，［定性処理］メニューの［定性処理テーブルの表示］をクリックして[定性処理テーブル]が開き，［化合物テーブルで指定したターゲットイオン］タブを選ぶと，コンパウンドファインダーで検出された結果がすべて表示されます。　特定の行を選択すると，[クロマトビュー]に検出されたピークが表示されます。

［GCMS再解析］ウィンドウで，[ポストラン]アシスタントバーの［ライブラリ編集］アイコンをクリックします。
[ファイル]メニューの[ライブラリの新規作成]で，ライブラリファイルの名前を入力します。
（既に，オリジナルライブラリがある場合は2.へ進む）

[ポストラン]アシスタントバーの［定性処理］アイコンを選択して，データ解析画面を表示します。　[ファイル]メニューの[データファイルを開く]で登録したいスペクトルを持つデータファイルを開きます。

［定性処理］メニューの［定性処理パラメータ］をクリックします。　[定性処理パラメータ]画面の［保持指標パラメータ］タブをクリックし，［基準化合物情報］を確認します。　基準化合物情報が登録されていない場合は，［データファイルから読み取り］ボタンをクリックし，基準化合物のデータファイルの読み込みを行ってください。　設定後，［OK］ボタンをクリックします。（保持指標の登録を行わない場合は4.へ進む）

[定性処理パラメータ]画面

ターゲットのピークトップをダブルクリックし，[スペクトルビュー]にマススペクトルを表示させます。　 ツールバーの［減算］ボタンをクリックし，[MSクロマトグラム]ビューをダブルクリックすると，その保持時間のスペクトルをバックグランドスペクトルとしてスペクトルの減算処理を行います。　[スペクトルビュー]に減算されたスペクトルを表示します。　［定性処理］メニューの［表示スペクトルをライブラリへ登録］を選択します。　[登録先の選択]画面が開きますので，1.で作成したライブラリファイルを選択します。

[定性処理パラメータ]画面

[化合物情報の編集]画面が開きます。　各インデックスについて入力できる項目を入力します。　[検索対象外]チェックボックスをオンにすると，このライブラリ使用時にシミラリティ検索の対象から外れます。　［OK］ボタンをクリックした時点で編集内容がディスク中のライブラリに書き込まれるのでご注意ください。　保持指標を直接入力する場合は，“ライブラリに保持指標を編集/入力したい”を参考ください。
注）NIST，Wiley，DRUGなどのパブリックライブラリには書き込みなどの変更はできません。

［定性処理］メニューの［TIC（全グループ）の波形処理］をクリックして，［定性処理パラメータ］画面を開き，波形処理パラメータを確認します。［OK］ボタンをクリックしてピークの検出を行います。
目的の成分が検出されない場合は，波形処理パラメータを変更し，再度波形処理をして，目的のピークが検出されることを確認してください。
全TICの波形処理で検出されたピークは定性処理テーブルに登録されています。　［定性処理］メニューの［定性処理テーブルの表示］で定性処理テーブルが開き，［TIC］タブをクリックします。
定性処理テーブルの検出されたピークから検索する化合物を選択，反転表示させます（テーブルの行を選択するとクロマトビューに選択したピークに縦ラインが入ります）。　定性処理テーブルの［編集］をクリックし，［スペクトル処理テーブルへ登録］でスペクトル処理テーブルに登録します。

［定性処理テーブル］画面

定性処理テーブルの［スペクトル処理テーブル］タブで，ライブラリに登録したい化合物を選択し，［編集］メニューの［ライブラリへ登録］を選択します。　［登録先の選択］画面が開くので，1.で作成したライブラリファイルを選択し，［開く］ボタンをクリックして，ライブラリに登録します。

［設定］画面

登録したライブラリファイルを開き，4で選択した化合物が登録されていることが確認します。　この状態では，スペクトルを登録しただけです，化合物名など化合物情報を入力する場合は，スペクトルビュー上の右クリックメニュー［化合物情報の編集］を選択します。
［化合物情報の編集］画面が開きます。　各インデックスについて入力できる項目を入力します。　入力後，［OK］ボタンを選択します。　この時点での編集内容がディスク中のライブラリに書き込まれるのでご注意ください。

［化合物情報の編集］画面

[ファイル]メニューの[ライブラリを開く]で構造式を登録したいライブラリを開きます。

[ファイル]メニューの[ライブラリを開く]で保持指標を編集/入力したいライブラリを開きます。
[ヒットリスト]で保持指標を編集/入力したい化合物の行をクリックし，[化合物情報]メニューの[化合物情報の編集]を選択します。 [化合物情報の編集]画面の［保持指標］に入力/編集します。 ［OK］ボタンをクリックした時点で編集内容がディスク中のライブラリに書き込まれるのでご注意ください。

[化合物情報の編集]画面