LC/MS/MS MRMライブラリ 代謝酵素(酵母)

LabSolutions Ver. 5用

バイオエタノール生産で注目される出芽酵母に由来する酵素の解析をサポート

 

  • Question
    酵母の代謝に関与する多数の酵素を解析したいのですが,MRM法によるモニタリング方法はありませんか?
  • Solution
    代謝酵素(酵母)MRMライブラリをお使いください。

 

1. 本ライブラリの特長

 

代謝酵素の分析に必要なMRM分析条件をご提供します

多数のタンパク質を分析するには膨大な数のMRM条件を検討する必要があります。本製品はこれらの分析条件を含むMRMライブラリであり,これを用いることでスムーズに分析業務を開始していただくことができます。ラボで検証済みのメソッドを用いるため,メソッド開発にかかる時間を大幅に短縮することができます。

安定同位体を用いた比較分析を行うことが可能です

全てのMRMトランジションに対して13CラベルされたペプチドのMRM分析条件を収載しています。これらを用いることにより,例えば非標識グルコースで生育した遺伝子欠損酵母グループと標識グルコースで生育したコントロール酵母グループの比較分析などを行うことが可能です。

酵母由来の一次代謝関連酵素の分析に適しています

バイオエタノールなどの物質生産やモデル生物として基礎研究が行われている出芽酵母に由来する228種類の酵素のトリプシン消化物全498ペプチドを対象とし,安定同位体を含む3584MRMトランジションから構成されるライブラリをご提供します。これらを用いることで,主要代謝経路である解糖系,TCA回路,ペントース・リン酸回路,アミノ酸代謝などに関連する酵素を測定することが可能です。

簡単にメソッドをカスタマイズできます

本パッケージに含まれるメソッドパラメータリストを利用してお客様が測定したい成分のみのメソッドを新しく作成することができます。

酵母の代謝酵素MRM測定ワークフロー
酵母の代謝酵素MRM測定ワークフロー

2. MRM分析例および登録代謝酵素のご紹介

遺伝子破壊株におけるGnd1pトリプシン消化ペプチドのMRM分析例

(a)非ラベルグルコースにて生育させたBY4742pfk1Δ株(Light) および(b)13C-ラベルグルコースにて生育させたS288C株(Heavy)の代表的なクロマトグラムを示しました。また,各種遺伝子破壊株におけるGnd1p のTICクロマトグラムを(c,d,およびe)に示しました。GND1破壊株ではGnd1pの発現は認められず,PFK1破壊株ではGnd1pが多く存在していることがわかります。

遺伝子破壊株におけるGnd1pトリプシン消化ペプチドのMRM分析例
遺伝子破壊株におけるGnd1pトリプシン消化ペプチドのMRM分析例
(Matsuda F, Ogura T, Tomita A, Hirano I, Shimizu H. Nano-scale liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry using the multiple reaction monitoring mode based quantitative platform for analyzing multiple enzymes associated with central metabolic pathways ofSaccharomyces cerevisiaeusing ultra fast mass spectrometryJ. Biosci. Bioeng.2015 Jan;119(1):117-20.より引用)

登録代謝酵素一覧

AAT1
AAT2
ACH1
ACO1
ACO2
ACS1
ACS2
ADE1
ADE12
ADE13
ADE16
ADE17
ADE2
ADE4
ADE5,7
ADE6
ADH1
ADH2
ADH3
ADH4
ADH6
ADK1
AGX1
ALD3
ALD4
ALD5
ALD6
ALT1
ALT2
ARG1
ARG2
ARG3
ARG4
ARG5,6
ARG8
ARO1
ARO2
ARO3
ARO4
ARO7
ARO8
ASN1
ASN2
ASP1
ATH1
BAT1
BAT2
BNA3
BNA5
CAR1
CAR2
CDC19
CIT1
CIT2
CIT3
CPA1
CPA2
CYS3
CYS4
DAK1
DAL7
DUR1,2
ECM17
ECM40
ENO1
ENO2
ERG10
ERG13
ERG20
ERR
FBA1
FBP1
FRD1
FUM1
GAD1
GAL1
GAL10
GAL7
GCV1
GCV2
GCY1
GDB1
GDH1
GDH2
GDH3
GLC3
GLK1
GLN1
GLT1
GLY1
GND1
GND2
GPD1
GPD2
GPH1
GPM1
GPM2
GPM3
GSY1
GSY2
GUA1
GUK1
GUT2
HIS1
HIS3
HIS4
HIS5
HIS6
HIS7
HOM2
HOM3
HOM6
HOR2
HXK1
HXK2
ICL1
IDH1
IDH2
IDP1
IDP2
IDP3
ILV1
ILV2
ILV3
ILV5
IMD2
IMD4
KGD1
KGD2
LAT1
LEU1
LEU2
LEU4
LPD1
LSC1
LSC2
LYS1
LYS12
LYS2
LYS20
LYS21
LYS4
LYS9
MAE1
MDH1
MDH2
MDH3
MET10
MET14
MET16
MET17
MET2
MET22
MET3
MET6
MHT1
MLS1
MVD1
NQM1
NTH1
PCK1
PDA1
PDB1
PDC1
PDC5
PDC6
PDE1
PFK1
PFK2
PGI1
PGK1
PGM1
PGM2
PRO1
PRO2
PRO3
PRS1
PRS2
PRS3
PRS4
PRS5
PYC1
PYC2
RHR2
RKI1
RNR2
RNR4
RPE1
SAH1
SAM1
SAM2
SAM4
SDH1
SDH2
SDH3
SDH4
SER1
SER2
SER3
SER33
SFA1
SHM2
SOL3
SOL4
TAL1
TDH1
TDH2
TDH3
THR1
THR4
TKL1
TKL2
TPI1
TPS1
TPS2
TPS3
TRP1
TRP2
TRP3
TRP5
TSL1
UGA1
UGA2
UGP1
URA2
YNK1
YPR1
ZWF1

I N F O R M A T I O N
⇒(関連製品 1)超高速トリプル四重極型LC/MS/MS LCMS-8050
⇒(関連製品 2)LC/MSソリューションシステムパッケージ一覧
 


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